Tür
Hata: 3 satırının sonunda geçerli bir bağlantı bulunamadı.
Biyolojide tür, sınıflandırmanın temel birimi ve bir organizmanın taksonomik derecesi olduğu kadar biyoçeşitliliğin de bir birimidir. Bir tür genellikle, uygun cinsiyetteki veya çiftleşme tipindeki herhangi iki bireyin, tipik olarak eşeyli üreme yoluyla verimli yavrular üretebildiği en büyük organizma grubu olarak tanımlanır. Türleri tanımlamanın diğer yolları arasında karyotip, DNA dizisi, morfoloji, davranış veya ekolojik niş yer alır. Ayrıca paleontologlar, fosil üremesi incelenemediği için krono-tür kavramını kullanmaktadır. ⓘ
Ökaryotların toplam tür sayısına ilişkin en son kesin tahmin 8 ila 8,7 milyon arasındadır. Ancak 2011 yılı itibariyle bunların sadece %14'ü tanımlanmıştır. ⓘ
Tüm türlere (virüsler hariç) iki parçalı bir isim, bir "binomial" verilir. Bir binomialin ilk kısmı türün ait olduğu cinstir. İkinci kısım ise özel isim veya özel epitet olarak adlandırılır (botanik isimlendirmede, bazen de zoolojik isimlendirmede). Örneğin, Boa constrictor, Boa cinsinin türlerinden biridir ve constrictor türün epitetidir. ⓘ
Yukarıda verilen tanımlar ilk bakışta yeterli görünse de, daha yakından bakıldığında sorunlu tür kavramlarını temsil etmektedir. Örneğin, yüzlerce benzer mikro türden oluşan bir tür kompleksinde ve bir halka türde, yakın akraba türler arasındaki sınırlar melezleşme ile belirsizleşir. Ayrıca, sadece eşeysiz üreyen organizmalar arasında, üreyen tür kavramı yıkılır ve her klon potansiyel olarak bir mikro türdür. Bunların hiçbiri tamamen tatmin edici tanımlar olmasa da ve tür kavramı yaşamın mükemmel bir modeli olmasa da, teorik zorluklara bakılmaksızın, bilim insanları ve korumacılar için Dünya'daki yaşamı incelemek için hala inanılmaz derecede yararlı bir araçtır. Eğer türler sabit ve birbirlerinden net bir şekilde farklı olsalardı sorun olmazdı, ancak evrimsel süreçler türlerin değişmesine neden olmaktadır. Bu durum taksonomistleri, örneğin bir soyun birden fazla krono-türe ayrılması gerektiğini beyan etmek için yeterli değişimin ne zaman meydana geldiğine veya popülasyonların kladistik türler olarak tanımlanacak kadar farklı karakter durumlarına sahip olacak şekilde ne zaman farklılaştığına karar vermek zorunda bırakmaktadır. ⓘ
Türler, Aristo zamanından 18. yüzyıla kadar, bir hiyerarşi, büyük varlık zinciri içinde düzenlenebilecek sabit kategoriler olarak görülmüştür. 19. yüzyılda biyologlar, yeterli zaman verildiğinde türlerin evrimleşebileceğini kavradılar. Charles Darwin'in 1859 tarihli Türlerin Kökeni Üzerine adlı kitabı türlerin doğal seçilim yoluyla nasıl ortaya çıkabileceğini açıklamıştır. Bu anlayış 20. yüzyılda genetik ve popülasyon ekolojisi aracılığıyla büyük ölçüde genişletildi. Genetik değişkenlik mutasyonlardan ve rekombinasyondan kaynaklanırken, organizmaların kendileri hareketlidir, bu da coğrafi izolasyona ve değişen seçilim baskılarıyla genetik sürüklenmeye yol açar. Genler bazen yatay gen transferi yoluyla türler arasında değiş tokuş edilebilir; hibridizasyon ve poliploidi yoluyla hızla yeni türler ortaya çıkabilir; ve türler çeşitli nedenlerle yok olabilir. Virüsler, mutasyon ve seçilim dengesi tarafından yönlendirilen özel bir durumdur ve quasispecies olarak ele alınabilir. ⓘ
Tür, ortak özellikler taşıyan ve çiftleştiğinde verimli döller verebilen, aynı veya yakın gen havuzunda bulunan biyolojik gruptur. ⓘ
Örneğin; Mavi ladinin bilimsel adı Picea pungens tir. Böylece yeryüzünün herhangi bir yerindeki bir bilim insanı bu türün Türkiye'de bulunan Picea orientalis (doğu ladini) ile yakın akraba olduğunu kolayca anlayabilir.Hatta bazı bilim adamları hala bulunmayan türlerin olduğunu söylemektedir. ⓘ
Türlerin birbirinden farklı oluşunu onların kalıtsal yapısı saptar. Bunlar yapısal, biyokimyasal, fiziksel ve davranışsal ayrıcalıklar olabilir. Tüm bunlara diagnostik özellikler denir. Birbirine yakın türler, belirli bir coğrafik bölgede birbirinden yalıtılmakta ya da çiftleşme zamanlarının farklılaşmasıyla, farklı davranışlara sahip olarak birbirinden kopmuş fakat önceden aynı gen havuzuna sahip olan populasyonlardır. Bu yakın türler yapay koşullar altında birbiriyle çiftleşerek yavru elde edilebilir. ⓘ
Türler sabit olmayıp kendi içinde daha alt birimlere ayrılabilir. Eğer bir tür iki veya daha çok alt tür veya varyete gibi alt taksonlara ayrılıyorsa bu türlere politipik tür eğer hiçbir alt türe ayrılmıyorsa buna monotipik tür denilir. Kimi durumlarda iki tür morfolojik bakımdan tamamen birbirinden ayrılmışlardır. Morfolojik bakımdan birbirinin benzeri olmasına karşın, üreme bakımından tamamen birbirinden ayrılmışlardır. Morfolojik bakımdan birbirinin aynı olduğu halde aralarında üreme engeli olan türlere ikiz tür adı verilir. ⓘ
Tanım
Biyologlar ve taksonomistler, morfolojiden başlayıp genetiğe doğru ilerleyerek türleri tanımlamak için birçok girişimde bulunmuşlardır. Linnaeus gibi ilk taksonomistlerin gördüklerini tanımlamaktan başka seçenekleri yoktu: bu daha sonra tipolojik veya morfolojik tür kavramı olarak resmileştirildi. Ernst Mayr üreme izolasyonunu vurgulamıştır, ancak bu da diğer tür kavramları gibi test edilmesi zor hatta imkansızdır. Daha sonraki biyologlar Mayr'ın tanımını diğerlerinin yanı sıra tanıma ve uyum kavramlarıyla geliştirmeye çalışmışlardır. Kavramların çoğu birbirine oldukça benzer ya da örtüşür, bu nedenle sayılmaları kolay değildir: biyolog R. L. Mayden yaklaşık 24 kavram kaydetmiş, bilim felsefecisi John Wilkins ise 26 kavram saymıştır. Wilkins ayrıca tür kavramlarını yedi temel kavram türüne ayırmıştır: (1) eşeysiz organizmalar için agamospecies (2) üreme açısından izole edilmiş eşeyli organizmalar için biyospecies (3) ekolojik nişlere dayalı ekospecies (4) soylara dayalı evrimsel türler (5) gen havuzuna dayalı genetik türler (6) biçim veya fenotipe dayalı morfospecies ve (7) bir taksonomist tarafından belirlenen bir tür olan taksonomik türler. ⓘ
Tipolojik veya morfolojik türler
Tipolojik bir tür, bireylerin belirli sabit özelliklere (bir tip) uyduğu bir organizma grubudur, böylece okuma yazma bilmeyen insanlar bile genellikle modern taksonomistlerle aynı taksonu tanırlar. Örnekler içindeki varyasyon kümeleri veya fenotipler (daha uzun veya daha kısa kuyruklar gibi) türleri farklılaştıracaktır. Bu yöntem, evrim teorisinin başlarında Linnaeus'ta olduğu gibi, türlerin belirlenmesinde "klasik" bir yöntem olarak kullanılmıştır. Ancak, farklı fenotiplerin farklı türler olması gerekmez (örneğin, iki kanatlı bir anneden doğan dört kanatlı bir Drosophila farklı bir tür değildir). Bu şekilde adlandırılan türlere morfospecies denir. ⓘ
1970'lerde Robert R. Sokal, Theodore J. Crovello ve Peter Sneath, morfolojik tür kavramının bir varyasyonu olan fenetik tür kavramını önermişlerdir. Bu kavram, fenotipleri birbirine benzeyen ancak diğer organizma kümelerinden farklı olan organizmalar kümesi olarak tanımlanmaktadır. Morfolojik tür kavramından farklı olarak, oldukça fazla sayıda fenotipik özelliğin çok değişkenli karşılaştırmalarına dayanan küme varlıklarına sayısal bir uzaklık veya benzerlik ölçüsü içerir. ⓘ
Tanıma ve uyum türleri
Eş tanıyan türler, birbirlerini potansiyel eş olarak tanıyan ve cinsel olarak üreyen bir grup organizmadır. Bunu çiftleşme sonrası izolasyona izin verecek şekilde genişletirsek, bir uyum türü, içsel uyum mekanizmaları yoluyla fenotipik uyum potansiyeline sahip bireylerin en kapsayıcı popülasyonudur; popülasyonlar başarılı bir şekilde melezleşebilse de, melezleşme miktarı ilgili gen havuzlarını tamamen karıştırmak için yetersizse, hala farklı uyum türleridir. Tanıma kavramının daha da geliştirilmesi biyosemiyotik tür kavramı tarafından sağlanmaktadır. ⓘ
Genetik benzerlik ve barkod türleri
Mikrobiyolojide genler, uzak akraba bakteriler arasında bile serbestçe hareket edebilir ve muhtemelen tüm bakteriyel alana yayılabilir. Genel bir kural olarak mikrobiyologlar, 16S ribozomal RNA gen dizilimleri birbirine %97'den daha fazla benzeyen bakteri veya arke türlerinin aynı türe ait olup olmadıklarına karar vermek için DNA-DNA hibridizasyonu ile kontrol edilmeleri gerektiğini varsaymışlardır. (Bkz.) Bu kavram 2006 yılında %98,7'lik bir benzerliğe indirgenmiştir. ⓘ
Ortalama nükleotid özdeşliği yöntemi, yaklaşık 10.000 baz çiftinden oluşan bölgeleri kullanarak tüm genomlar arasındaki genetik mesafeyi ölçer. Bir cinsin genomlarından elde edilen yeterli veri ile algoritmalar, 2013 yılında Pseudomonas avellanae ve 2020'den bu yana dizilenen tüm bakteri ve arkeler için olduğu gibi türleri kategorize etmek için kullanılabilir. ⓘ
DNA barkodlama, uzman olmayanların bile kullanabileceği türleri ayırt etmenin bir yolu olarak önerilmiştir. Barkodlardan biri, sitokrom c oksidaz geni içindeki mitokondriyal DNA bölgesidir. Barcode of Life Data Systems adlı bir veritabanı 190.000'den fazla türe ait DNA barkod dizilerini içermektedir. Ancak Rob DeSalle gibi bilim insanları, türleri farklı şekilde sınırlandırdıkları için klasik taksonomi ile yanlış bir adlandırma olarak gördükleri DNA barkodlamanın uzlaştırılması gerektiğine dair endişelerini dile getirmişlerdir. Endosimbiontlar ve diğer vektörlerin aracılık ettiği genetik introgresyon, barkodları türlerin tanımlanmasında daha da etkisiz hale getirebilir. ⓘ
Filogenetik veya kladistik türler
Filogenetik veya kladistik tür, "karşılaştırılabilir bireylerdeki (semaforontlar) karakter durumlarının benzersiz bir kombinasyonu ile teşhis edilebilen popülasyonların (eşeyli) veya soyların (eşeysiz) en küçük toplamıdır". Ampirik temel - gözlemlenen karakter durumları - zaman ve mekan boyunca kalıtsal bütünlüklerini koruyan evrimsel olarak farklı soylar hakkındaki hipotezleri desteklemek için kanıt sağlar. Moleküler belirteçler, çeşitli türlerin nükleer veya mitokondriyal DNA'sındaki tanısal genetik farklılıkları belirlemek için kullanılabilir. Örneğin, mantarlar üzerinde yapılan bir çalışmada, kladistik türler kullanılarak nükleotid karakterlerinin incelenmesi, incelenen tüm kavramlar arasında çok sayıda mantar türünün tanınmasında en doğru sonuçları vermiştir. Filogenetik tür kavramının monofiliyi veya teşhis edilebilirliği vurgulayan versiyonları, örneğin Bovidae'de, üreme engelleri olmamasına ve popülasyonların morfolojik olarak birbirleriyle geçiş yapabilmesine rağmen, eski alt türleri tür olarak tanıyarak mevcut türlerin bölünmesine yol açabilir. Diğerleri bu yaklaşımı, tür kavramını sulandıran ve taksonomiyi istikrarsız hale getiren taksonomik enflasyon olarak adlandırmıştır. Bazıları ise bu yaklaşımı savunmakta, "taksonomik enflasyon "u aşağılayıcı bulmakta ve karşıt görüşü "taksonomik muhafazakarlık" olarak nitelendirmektedir; türleri ayırmanın ve daha küçük popülasyonları tür düzeyinde tanımanın siyasi açıdan uygun olduğunu, çünkü bu sayede IUCN kırmızı listesine daha kolay tehlike altında olarak dahil edilebileceklerini ve koruma mevzuatı ve finansmanını çekebileceklerini iddia etmektedirler. ⓘ
Biyolojik tür kavramının aksine, kladistik tür üreme izolasyonuna dayanmaz - kriterleri diğer kavramların ayrılmaz bir parçası olan süreçlerden bağımsızdır. Bu nedenle, eşeysiz soylar için geçerlidir. Bununla birlikte, taksonlar arasında her zaman net ve sezgisel olarak tatmin edici sınırlar sağlamaz ve makul sonuçlar vermek için birden fazla polimorfik lokus gibi birden fazla kanıt kaynağı gerektirebilir. ⓘ
Evrimsel türler
George Gaylord Simpson tarafından 1951'de önerilen evrimsel tür, "zaman ve mekan boyunca kimliğini diğer benzer varlıklardan koruyan ve kendi bağımsız evrimsel kaderi ve tarihsel eğilimleri olan organizmalardan oluşan bir varlıktır". Bu, biyolojik tür kavramından zaman içinde sürekliliği somutlaştırması bakımından farklıdır. Wiley ve Mayden, evrimsel tür kavramını Willi Hennig'in soy olarak tür kavramıyla "özdeş" olarak gördüklerini belirtmiş ve biyolojik tür kavramının, filogenetik tür kavramının "çeşitli versiyonlarının" ve türlerin daha yüksek taksonlarla aynı türden olduğu fikrinin biyoçeşitlilik çalışmaları için (tür sayısını doğru bir şekilde tahmin etmek amacıyla) uygun olmadığını ileri sürmüşlerdir. Ayrıca bu kavramın hem eşeysiz hem de eşeyli üreyen türler için geçerli olduğunu öne sürmüşlerdir. Bu kavramın bir versiyonu da Kevin de Queiroz'un "Türlerin Genel Soy Kavramı "dır. ⓘ
Ekolojik türler
Ekolojik bir tür, çevrede niş olarak adlandırılan belirli bir kaynak kümesine adapte olmuş bir dizi organizmadır. Bu kavrama göre, popülasyonlar tür olarak tanıdığımız ayrı fenetik kümeleri oluşturur çünkü kaynakların nasıl paylaşıldığını kontrol eden ekolojik ve evrimsel süreçler bu kümeleri üretme eğilimindedir. ⓘ
Genetik türler
Robert Baker ve Robert Bradley tarafından tanımlandığı şekliyle genetik bir tür, genetik olarak izole edilmiş melez popülasyonlar kümesidir. Bu Mayr'ın Biyolojik Tür Kavramına benzer, ancak üreme izolasyonundan ziyade genetik izolasyona vurgu yapar. 21. yüzyılda, genetik bir tür DNA dizilerinin karşılaştırılmasıyla belirlenebilir, ancak daha önce karyotiplerin (kromozom setleri) ve allozimlerin (enzim varyantları) karşılaştırılması gibi başka yöntemler de mevcuttu. ⓘ
Evrimsel açıdan önemli birim
Evrimsel açıdan önemli bir birim (ESU) veya "yaban hayatı türü", koruma amacıyla farklı kabul edilen bir organizma popülasyonudur. ⓘ
Kronospecies
Paleontolojide, kanıt olarak sadece fosillerden elde edilen karşılaştırmalı anatomi (morfoloji) ile krono-tür kavramı uygulanabilir. Anagenez (evrim, dallanma içermesi gerekmez) sırasında paleontologlar, her biri sürekli, yavaş ve az çok tekdüze bir değişim yoluyla bir önceki fiziksel olarak yok olmuş türden türeyen bir dizi türü tanımlamaya çalışırlar. Böyle bir zaman dizisinde paleontologlar, morfolojik olarak farklı bir formun atalarından farklı bir tür olarak kabul edilmesi için ne kadar değişim gerektiğini değerlendirir. ⓘ
Viral quasispecies
Virüsler muazzam popülasyonlara sahiptir, bir protein kılıfı içinde bir DNA veya RNA dizisinden biraz daha fazlasından oluştukları için yaşadıkları şüphelidir ve hızla mutasyona uğrarlar. Tüm bu faktörler, geleneksel tür kavramlarını büyük ölçüde uygulanamaz hale getirmektedir. Bir viral quasispecies, benzer mutasyonlarla ilişkili, oldukça mutajenik bir ortamda rekabet eden ve dolayısıyla bir mutasyon-seçilim dengesi tarafından yönetilen bir grup genotiptir. Uygunluk ortamında düşük ancak evrimsel olarak nötr ve yüksek bağlantılı (yani düz) bir bölgede bulunan viral bir quasispecies'in, çevredeki mutantların uygun olmadığı daha yüksek ancak daha dar bir uygunluk zirvesinde bulunan bir quasispecies'e üstün geleceği tahmin edilmektedir, "quasispecies etkisi" veya "en düz olanın hayatta kalması". Viral bir quasispecies'in geleneksel bir biyolojik türe benzediğine dair hiçbir öneri yoktur. Uluslararası Virüs Taksonomisi Komitesi 1962'den beri virüsler için evrensel bir taksonomik şema geliştirmiştir; bu da viral taksonomiyi stabilize etmiştir. ⓘ
Taksonomi ve adlandırma
Yaygın ve bilimsel isimler
Organizma türleri için yaygın olarak kullanılan isimler genellikle belirsizdir: "kedi" evcil kedi Felis catus veya kedi ailesi Felidae anlamına gelebilir. Yaygın isimlerle ilgili bir başka sorun da bu isimlerin genellikle bölgeden bölgeye değişiklik göstermesidir: puma, puma, katamount, panter, ressam ve dağ aslanı Amerika'nın çeşitli bölgelerinde Puma concolor anlamına gelirken, "panter" Latin Amerika'daki jaguar (Panthera onca) veya Afrika ve Asya'daki leopar (Panthera pardus) anlamına da gelebilir. Buna karşılık, türlerin bilimsel isimleri benzersiz ve evrensel olacak şekilde seçilir; birlikte kullanılan iki kısımdan oluşur: Puma'da olduğu gibi cins ve concolor'da olduğu gibi özel epitet. ⓘ
Tür tanımı
Bir türe taksonomik bir isim, tip örneği resmi olarak tanımlandığında, ona benzersiz bir bilimsel isim veren bir yayında verilir. Tanımlama tipik olarak yeni türün tanımlanması, daha önce tanımlanmış ve ilişkili veya karıştırılabilir diğer türlerden ayırt edilmesi için araçlar sağlar ve makale yayın için kabul edildiğinde geçerli bir şekilde yayınlanmış bir isim (botanikte) veya mevcut bir isim (zoolojide) sağlar. Tip materyali genellikle bağımsız doğrulamaya ve örneklerin karşılaştırılmasına olanak tanıyan kalıcı bir depoda, genellikle büyük bir müze veya üniversitenin araştırma koleksiyonunda tutulur. Yeni türleri tanımlayanlardan, Uluslararası Zoolojik Adlandırma Kuralları'nın ifadesiyle, "uygun, kompakt, kulağa hoş gelen, akılda kalıcı ve kırıcı olmayan" isimler seçmeleri istenir. ⓘ
Kısaltmalar
Kitaplar ve makaleler bazen kasıtlı olarak türleri tam olarak tanımlamaz, tekil olarak "sp." kısaltmasını veya çoğul olarak "spp." kısaltmasını kullanır. (Latince "çoklu türler" anlamına gelen species pluralis) kısaltmasını özel isim veya epitet (örneğin Canis sp.) yerine çoğul olarak kullanmaktadır. Bu durum genellikle, paleontolojide yaygın olduğu üzere, yazarlar bazı bireylerin belirli bir cinse ait olduğundan emin olduklarında ancak tam olarak hangi türe ait olduklarından emin olamadıklarında ortaya çıkar. ⓘ
Yazarlar ayrıca "spp." ifadesini bir şeyin bir cins içindeki birçok tür için geçerli olduğunu, ancak hepsi için geçerli olmadığını söylemenin kısa bir yolu olarak da kullanabilirler. Bilim insanları bir şeyin bir cins içindeki tüm türler için geçerli olduğunu söylemek istiyorlarsa, özel isim veya epitet olmadan cins adını kullanırlar. Cins ve tür isimleri genellikle italik olarak basılır. Ancak, "sp." gibi kısaltmalar italik yazılmamalıdır. ⓘ
Bir türün kimliği net olmadığında, bir uzman teyit gerektiğini belirtmek için epitetten önce "cf." kullanabilir. "nr." kısaltmaları (yakın) veya "aff." (yakın) kısaltmaları, türün kimliği belirsiz olduğunda ancak türün daha sonra bahsedilen türe benzer göründüğü durumlarda kullanılabilir. ⓘ
Tanımlama kodları
Çevrimiçi veri tabanlarının yükselişiyle birlikte, halihazırda tanımlanmış olan türler için tanımlayıcılar sağlamak üzere kodlar geliştirilmiştir:
- Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi (NCBI) sayısal bir 'taksid' ya da Taksonomi tanımlayıcısı, bir "sabit benzersiz tanımlayıcı" kullanmaktadır, örneğin Homo sapiens'in taksidi 9606'dır.
- Kyoto Genler ve Genomlar Ansiklopedisi (KEGG) sınırlı sayıda organizma için üç veya dört harfli bir kod kullanır; bu kodda örneğin H. sapiens sadece hsa'dır.
- UniProt, beş alfanümerik karakterden fazla olmayan bir "organizma anımsatıcısı" kullanır, örneğin H. sapiens için HUMAN.
- Entegre Taksonomik Bilgi Sistemi (ITIS) her tür için benzersiz bir numara sağlar. Homo sapiens için LSID şöyledir urn:lsid:catalogueoflife.org:taxon:4da6736d-d35f-11e6-9d3f-bc764e092680:col20170225. ⓘ
Toplama ve bölme
Belirli bir türün adlandırılması, hangi cinse (ve daha yüksek taksonlara) yerleştirildiği de dahil olmak üzere, o organizma grubunun evrimsel ilişkileri ve ayırt edilebilirliği hakkında bir hipotezdir. Daha fazla bilgi elde edildikçe, hipotez doğrulanabilir veya çürütülebilir. Bazen, özellikle de iletişimin daha zor olduğu geçmişte, izole bir şekilde çalışan taksonomistler, daha sonra aynı tür olarak tanımlanan bireysel organizmalara iki farklı isim vermişlerdir. İki tür adının aynı tür için geçerli olduğu keşfedildiğinde, eski tür adına öncelik verilir ve genellikle korunur ve daha yeni olan ad, sinonimi adı verilen bir süreç olan küçük sinonim olarak kabul edilir. Bir taksonun birden fazla, genellikle yeni taksonlara bölünmesine bölme denir. Taksonomistler, organizmalar arasındaki farklılıkları veya ortaklıkları tanımaya yönelik kişisel yaklaşımlarına bağlı olarak, meslektaşları tarafından genellikle "topaklayıcılar" veya "bölücüler" olarak adlandırılırlar. Taksonların sınırlandırılması, uzmanların takdirine bağlı taksonomik bir karar olarak kabul edilir ve Zoolojik veya Botanik İsimlendirme Kodları tarafından yönetilmez. ⓘ
Geniş ve dar anlamlar
Hayvanlar için ICZN ve bitkiler için ICN dahil olmak üzere türlerin adlandırılmasına rehberlik eden isimlendirme kodları, türlerin sınırlarını tanımlamak için kurallar koymaz. Araştırmalar, yeni kanıtlara dayanarak çevre tanımlaması olarak da bilinen sınırları değiştirebilir. Bu durumda türlerin kullanılan sınır tanımlarına göre ayırt edilmesi gerekebilir ve bu gibi durumlarda isimler, türe adını veren kişi gibi bir yazar tarafından verilen tam anlamıyla kullanımı belirtmek için sensu stricto ("dar anlamda") ile nitelenebilirken, zıt anlamlı sensu lato ("geniş anlamda"), örneğin diğer alt türleri de içeren daha geniş bir kullanımı belirtir. "auct." ("yazar") gibi diğer kısaltmalar ("yazar") gibi diğer kısaltmalar ve "non" ("değil") gibi niteleyiciler, belirtilen yazarların türleri hangi anlamda tanımladığını veya tarif ettiğini daha da netleştirmek için kullanılabilir. ⓘ
Mayr'ın biyolojik tür kavramı
Çoğu modern ders kitabı, türlerin tanımına ilişkin daha ileri tartışmalar için bir temel olarak Biyolojik Tür Kavramı olarak bilinen Ernst Mayr'ın 1942 tanımını kullanmaktadır. Buna üreme ya da izolasyon kavramı da denmektedir. Bu, bir türü şu şekilde tanımlar ⓘ
Üreme açısından diğer gruplardan izole edilmiş, gerçekte veya potansiyel olarak birbiriyle melezleşen doğal popülasyon grupları. ⓘ
Bu tanımın, eşeyli üremenin doğal seçilim dinamikleri üzerindeki etkisinin doğal bir sonucu olduğu ileri sürülmüştür. Mayr'ın "potansiyel olarak" sıfatını kullanması bir tartışma konusu olmuştur; bazı yorumlar yalnızca esaret altında gerçekleşen ya da çiftleşme yeteneğine sahip ancak normalde vahşi doğada bunu yapmayan hayvanları içeren olağandışı veya yapay çiftleşmeleri hariç tutmaktadır. ⓘ
Tür sorunu
Bir türü tüm organizmalar için geçerli olacak şekilde tanımlamak zordur. Tür kavramları hakkındaki tartışma tür sorunu olarak adlandırılmaktadır. Bu sorun, Darwin'in Türlerin Kökeni Üzerine adlı kitabını yazdığı 1859 yılında bile fark edilmişti:
Hiçbir tanım tüm doğa bilimcileri tatmin etmemiştir; yine de her doğa bilimci bir türden bahsederken neyi kastettiğini belli belirsiz bilir. Genel olarak bu terim, farklı bir yaratılış eyleminin bilinmeyen unsurunu içerir. ⓘ
Mayr'ın kavramı bozulduğunda
Mayr'ın kavramını takip eden basit bir ders kitabı tanımı, çok hücreli organizmaların çoğu için işe yarar, ancak birkaç durumda bozulur:
- Bakteriler ve diğer prokaryotlar gibi tek hücreli organizmalarda ve partenogenetik veya apomiktik çok hücreli organizmalarda olduğu gibi organizmalar eşeysiz olarak ürediğinde. DNA barkodlama ve filogenetik bu durumlarda yaygın olarak kullanılmaktadır. Quasispecies terimi bazen virüsler gibi hızla mutasyona uğrayan varlıklar için kullanılır.
- Bilim insanları morfolojik olarak benzer iki organizma grubunun birbiriyle çiftleşip çiftleşemeyeceğini bilmediğinde; bu durum paleontolojide soyu tükenmiş tüm yaşam formları için geçerlidir, çünkü üreme deneyleri mümkün değildir.
- Hibridizasyon türler arasında önemli gen akışına izin verdiğinde.
- Halka türlerde, geniş bir dağılım aralığındaki bitişik popülasyonların üyeleri başarılı bir şekilde melezleşirken, daha uzak popülasyonların üyeleri melezleşmez. ⓘ
_(cropped).jpg)
Moleküler ve morfolojik incelemeler arasındaki uyumsuzluk tür tanımlamasını zorlaştırmaktadır; bunlar iki tür olarak sınıflandırılabilir: (i) tek morfoloji, çoklu soylar (örn. morfolojik yakınsama, kriptik türler) ve (ii) tek soy, çoklu morfolojiler (örn. fenotipik plastisite, çoklu yaşam döngüsü aşamaları). Buna ek olarak, yatay gen transferi (HGT) bir türün tanımlanmasını zorlaştırmaktadır. Tüm tür tanımları, bir organizmanın genlerini "yavru" organizmaya çok benzeyen bir veya iki ebeveynden aldığını varsayar, ancak HGT'de olan bu değildir. Çok farklı prokaryot grupları arasında ve en azından ara sıra bazı kabuklular ve ekinodermler de dahil olmak üzere farklı ökaryot grupları arasında HGT'ye dair güçlü kanıtlar vardır. ⓘ
Evrimsel biyolog James Mallet şu sonuca varmıştır ⓘ
Birbiriyle ilişkili coğrafi veya zamansal formların aynı türe mi yoksa farklı türe mi ait olduğunu söylemenin kolay bir yolu yoktur. Türler arasındaki boşluklar yalnızca yerel olarak ve belirli bir zaman noktasında doğrulanabilir. Darwin'in görüşünün doğru olduğunu kabul etmek zorunda kalırız: türlerin herhangi bir yerel gerçekliği ya da bütünlüğü, geniş coğrafi aralıklarda ve zaman dilimlerinde büyük ölçüde azalır. ⓘ
Mikro türlerin toplamları
Tür kavramı, birçok bitki de dahil olmak üzere, çok az genetik değişkenliğe sahip ve genellikle tür kümeleri oluşturan organizma grupları olan mikro türlerin varlığıyla daha da zayıflamaktadır. Örneğin, karahindiba Taraxacum officinale ve böğürtlen Rubus fruticosus, birçok mikro türe sahip kümelerdir - böğürtlende belki 400, karahindibada 200'den fazla, melezleşme, apomiksis ve poliploidi ile karmaşıklaşan, popülasyonlar arasındaki gen akışını belirlemeyi zorlaştıran ve taksonomilerini tartışmalı hale getiren kümelerdir. Tür kompleksleri Heliconius kelebekleri gibi böceklerde, Hypsiboas ağaç kurbağaları gibi omurgalılarda ve sinek mantarı gibi mantarlarda görülür. ⓘ
Böğürtlenler Rubus fruticosus tür kümesinin yüzlerce mikro türünden herhangi birine aittir.
Heliconius kelebek cinsi birçok benzer tür içerir.
Hypsiboas calcaratus-fasciatus tür kompleksi en az altı ağaç kurbağası türü içerir. ⓘ
Melezleşme
Doğal hibridizasyon, üreme açısından izole tür kavramına meydan okumaktadır, çünkü verimli hibridler iki popülasyon arasında gen akışına izin vermektedir. Örneğin, leş kargası Corvus corone ve kapüşonlu karga Corvus cornix ayrı türler olarak görünür ve sınıflandırılır, ancak coğrafi aralıklarının çakıştığı yerlerde serbestçe melezleşirler. ⓘ
- Leş kargaları ile kukuletalı kargaların melezleşmesi 'türler' arasında gen akışına izin veriyor
Leş kargası
Koyu göbekli, koyu gri enseli melez
Koyu göbekli melez
Kukuletalı karga ⓘ
_(cropped).JPG)
.jpg)
Halka türleri
Bir halka tür, her biri komşu akraba popülasyonlarla cinsel olarak melezleşebilen, ancak her bir "bağlantılı" popülasyon arasında potansiyel bir gen akışı olmasına rağmen, seride melezleşemeyecek kadar uzak akraba olan en az iki "uç" popülasyonun bulunduğu bağlantılı bir komşu popülasyon serisidir. Bu tür üremeyen, ancak genetik olarak bağlantılı "uç" popülasyonlar aynı bölgede birlikte var olabilir ve böylece halkayı kapatabilir. Dolayısıyla halka türler, üreme izolasyonuna dayanan herhangi bir tür kavramı için zorluk teşkil etmektedir. Bununla birlikte, halka türler en iyi ihtimalle nadirdir. Önerilen örnekler arasında Kuzey kutbu çevresindeki ringa martısı-küçük kara sırtlı martı kompleksi, Amerika'daki 19 semender popülasyonundan oluşan Ensatina eschscholtzii grubu ve Asya'daki yeşilimsi ötleğen yer almaktadır, ancak halka tür olarak adlandırılan birçok türün yanlış sınıflandırmanın sonucu olduğu ortaya çıkmış ve bu da gerçekten halka tür olup olmadığı konusunda soru işaretlerine yol açmıştır. ⓘ
Larus martılarının yedi "türü" Kuzey Kutbu'nun etrafındaki bir halkada melezleşir.
Halkanın karşıt uçları: Norveç'te bir ringa martısı (Larus argentatus) (önde) ve bir küçük kara sırtlı martı (Larus fuscus)
Yeşilimsi bir ötleğen, Phylloscopus trochiloides
Himalayalar çevresindeki yeşilimsi ötleğenlerin beş "türünün" evrimleştiği varsayılıyor ⓘ
Değişim
Türler, yeni türlere evrimleşerek, diğer türlerle gen alışverişinde bulunarak, diğer türlerle birleşerek veya soyları tükenerek değişime tabidir. ⓘ
Türleşme
Biyolojik popülasyonların evrimleşerek türler olarak farklılaştığı veya üreme açısından izole olduğu evrimsel sürece türleşme denir. Charles Darwin, 1859 tarihli Türlerin Kökeni adlı kitabında türleşmede doğal seçilimin rolünü tanımlayan ilk kişidir. Türleşme, üreme izolasyonunun bir ölçüsüne, gen akışının azalmasına bağlıdır. Bu durum, popülasyonların coğrafi olarak ayrıldığı ve mutasyonlar biriktikçe kademeli olarak farklılaşabildiği allopatrik türleşmede en kolay şekilde gerçekleşir. Üreme izolasyonu hibridizasyon tarafından tehdit edilir, ancak Bateson-Dobzhansky-Muller modelinde açıklandığı gibi, bir çift popülasyon aynı genin uyumsuz alellerine sahip olduğunda buna karşı seçilebilir. Farklı bir mekanizma olan filetik türleşme, bir soyun zaman içinde kademeli olarak yeni ve farklı bir forma dönüşmesini ve bunun sonucunda ortaya çıkan türlerin sayısının artmamasını içerir. ⓘ
Türler arasında gen alışverişi
.svg){kind=spacer}
Farklı türlerdeki organizmalar arasında hibridizasyon, antijenik kayma veya reassortment yoluyla yatay gen transferi bazen önemli bir genetik varyasyon kaynağıdır. Virüsler genleri türler arasında aktarabilir. Bakteriler, farklı filogenetik alanlardaki görünüşte uzak akraba olanlar da dahil olmak üzere diğer türlerin bakterileriyle plazmid alışverişinde bulunabilir, bu da ilişkilerinin analizini zorlaştırır ve bakteri türü kavramını zayıflatır. ⓘ
Louis-Marie Bobay ve Howard Ochman, birçok bakteri türünün genomlarının analizine dayanarak, bitkilerin ve hayvanların üreme açısından izole edilmiş üreme popülasyonları olarak gruplandırılabildiği gibi, bunların da genellikle "düzenli olarak gen takası yapan topluluklar halinde" gruplandırılabileceğini öne sürmektedir. Dolayısıyla bakteriler, Mayr'ın biyolojik tür kavramına benzer şekilde, homolog rekombinasyon yoluyla gen alışverişinde bulunan eşeysiz üreyen popülasyonlardan oluşan türler oluşturabilir. ⓘ
Soy tükenmesi
Bir türün soyu, o türün son bireyi öldüğünde tükenir, ancak o andan çok önce işlevsel olarak tükenmiş olabilir. Dünya üzerinde yaşamış tüm türlerin yüzde 99'undan fazlasının, yani yaklaşık beş milyar türün neslinin tükenmiş olduğu tahmin edilmektedir. Bunlardan bazıları Ordovisyen, Devoniyen, Permiyen, Triyas ve Kretase dönemlerinin sonlarında olduğu gibi kitlesel yok oluşlar şeklinde gerçekleşmiştir. Kitlesel yok oluşların volkanik faaliyetler, iklim değişikliği, okyanus ve atmosfer kimyasındaki değişiklikler gibi çeşitli nedenleri vardır ve bunların da Dünya'nın ekolojisi, atmosferi, kara yüzeyi ve suları üzerinde büyük etkileri olmuştur. Yok oluşun bir başka biçimi de bir türün melezleşme yoluyla başka bir tür tarafından asimile edilmesidir. Ortaya çıkan tek tür "compilospecies" olarak adlandırılmıştır. ⓘ
Pratik çıkarımlar
Biyologlar ve doğa koruma uzmanları çalışmaları sırasında organizmaları kategorize etmek ve tanımlamak zorundadır. Organizmaları güvenilir bir şekilde bir türe atamanın zorluğu, araştırma sonuçlarının geçerliliği için bir tehdit oluşturmaktadır; örneğin bir türün bir ekosistemde ne kadar bol olduğuna dair ölçümleri tartışmalı hale getirmektedir. Filogenetik tür kavramını kullanan araştırmalar, filogenetik olmayan kavramları kullananlara kıyasla %48 daha fazla tür ve buna bağlı olarak daha küçük popülasyonlar ve menziller rapor etmiştir; bu durum "taksonomik enflasyon" olarak adlandırılmıştır ve tehlike altındaki türlerin sayısında yanlış bir değişim görüntüsüne ve bunun sonucunda politik ve pratik zorluklara neden olabilir. Bazı gözlemciler türleşme süreçlerini anlama arzusu ile tanımlama ve kategorize etme ihtiyacı arasında içsel bir çatışma olduğunu iddia etmektedir. ⓘ
Birçok ülkedeki koruma yasaları, türlerin yok olmasını önlemek için özel hükümler getirmektedir. Biri koruma altında olan diğeri olmayan iki tür arasındaki melezleşme bölgeleri bazen kanun koyucular, arazi sahipleri ve korumacılar arasında çatışmalara yol açmıştır. Kuzey Amerika'daki klasik vakalardan biri, koruma altındaki kuzey benekli baykuşun koruma altında olmayan Kaliforniya benekli baykuşu ve çubuklu baykuş ile melezleşmesidir; bu durum yasal tartışmalara yol açmıştır. Tür sorununun, tür kavramının farklı kullanımlarından kaynaklandığı ve çözümün bu kavramı ve diğer tüm taksonomik sıralamaları terk etmek ve bunun yerine sıralanmamış monofiletik grupları kullanmak olduğu ileri sürülmüştür. Türler karşılaştırılabilir olmadığından, onları saymanın geçerli bir biyoçeşitlilik ölçütü olmadığı da ileri sürülmüştür; alternatif filogenetik biyoçeşitlilik ölçütleri önerilmiştir. ⓘ
Tarihçe
Klasik formlar
Aristoteles biyolojisinde γένος (génos) terimini kuş ya da balık gibi bir tür anlamında, εἶδος (eidos) terimini ise turna, kartal, karga ya da serçe gibi (kuşlar içinde) bir tür içindeki belirli bir form anlamında kullanmıştır. Bu terimler Latinceye "cins" ve "tür" olarak çevrilmiştir, ancak bu şekilde adlandırılan Linnean terimlerine karşılık gelmezler; bugün kuşlar bir sınıf, turnalar bir aile ve kargalar bir cinstir. Bir tür, nitelikleriyle ayırt edilirdi; örneğin bir kuşun tüyleri, gagası, kanatları, sert kabuklu bir yumurtası ve sıcak kanı vardır. Bir form, tüm üyeleri tarafından paylaşılmasıyla ayırt edilirdi, yavrular ebeveynlerinden sahip olabilecekleri herhangi bir varyasyonu miras alırlardı. Aristoteles tüm türlerin ve biçimlerin farklı ve değişmez olduğuna inanıyordu. Onun yaklaşımı Rönesans'a kadar etkisini sürdürmüştür. ⓘ
Sabit türler
Erken Modern dönemdeki gözlemciler canlılar için organizasyon sistemleri geliştirmeye başladıklarında, her bir hayvan veya bitki türünü bir bağlama yerleştirdiler. Bu erken dönem tanımlama şemalarının birçoğu bugün kaprisli olarak değerlendirilebilir: şemalar renk (sarı çiçekli tüm bitkiler) veya davranış (yılanlar, akrepler ve bazı ısırıcı karıncalar) temelli akrabalıkları içeriyordu. İngiliz doğa bilimci John Ray, 1686 yılında türlerin biyolojik tanımını aşağıdaki gibi yapan ilk kişidir:
Türleri belirlemek için, tohumdan çoğalırken kendilerini devam ettiren ayırt edici özelliklerden daha kesin bir kriter aklıma gelmedi. Dolayısıyla, bireylerde ya da türlerde ne tür farklılıklar olursa olsun, eğer bunlar bir ve aynı bitkinin tohumundan kaynaklanıyorsa, bunlar tesadüfi farklılıklardır ve bir türü ayırt edecek nitelikte değildir... Aynı şekilde, özel olarak farklılık gösteren hayvanlar da farklı türlerini kalıcı olarak korurlar; bir tür asla diğerinin tohumundan çıkmaz ya da tam tersi. ⓘ
18. yüzyılda İsveçli bilim insanı Carl Linnaeus, organizmaları sadece farklılıklarına göre değil, paylaşılan fiziksel özelliklerine göre sınıflandırdı. Gözlemlenebilir özelliklere dayanan ve doğal ilişkileri yansıtmayı amaçlayan taksonomik bir sınıflandırma hiyerarşisi fikrini oluşturdu. Ancak o dönemde, ne kadar benzer görünürlerse görünsünler, türler arasında organik bir bağ olmadığına hala yaygın olarak inanılıyordu. Bu görüş, yaşam kategorilerinin Tanrı tarafından belirlendiğini ve Aristotelesçi bir hiyerarşi, scala naturae veya büyük varlık zinciri oluşturduğunu savunan Avrupa akademik ve dini eğitiminden etkilenmiştir. Bununla birlikte, sabit olduğu varsayılsın ya da varsayılmasın, scala (bir merdiven) doğası gereği tırmanma olasılığını ima ediyordu. ⓘ
Değişkenlik
Linnaeus, melezleşme kanıtlarını incelerken türlerin sabit olmadığını ve değişebileceğini kabul etti; yeni türlerin ortaya çıkabileceğini düşünmedi ve melezleşme veya iklimlendirme süreçleriyle değişebilecek ilahi olarak sabit türler görüşünü sürdürdü. 19. yüzyıla gelindiğinde, doğa bilimciler türlerin zaman içinde biçim değiştirebileceğini ve gezegenin tarihinin büyük değişimler için yeterli zaman sağladığını anladılar. Jean-Baptiste Lamarck, 1809 tarihli Zooloji Felsefesi adlı eserinde, Aristotelesçi düşünceden radikal bir şekilde ayrılarak, bir türün zaman içinde değişebileceğini öne sürerek, türlerin transmutasyonunu tanımlamıştır. ⓘ
1859'da Charles Darwin ve Alfred Russel Wallace evrim ve yeni türlerin oluşumu hakkında ikna edici bir açıklama yaptılar. Darwin, bireyler arasında doğal olarak meydana gelen varyasyondan doğal seçilim yoluyla evrimleşenin bireyler değil popülasyonlar olduğunu savundu. Bu, türlerin yeni bir tanımını gerektiriyordu. Darwin, türlerin göründükleri gibi oldukları sonucuna vardı: etkileşim halindeki bireylerden oluşan grupları adlandırmak için geçici olarak yararlı olan fikirler, diye yazıyordu:
Tür terimine, birbirine çok benzeyen bir dizi bireye kolaylık sağlamak amacıyla keyfi olarak verilen bir terim olarak bakıyorum ... Daha az belirgin ve daha değişken formlara verilen varyete kelimesinden esasen farklı değildir. Çeşitlilik terimi de, salt bireysel farklılıklarla karşılaştırıldığında, yine keyfi olarak ve kolaylık olsun diye kullanılmaktadır. ⓘ